Program Studi Sejarah peradaban Islam, Fakultas Ushuluddin, Adab, dan Humaniora UIN Salatiga didirikan pertama kali pada tahun 2012 dengan nama Sejarah dan Kebudayaan Islan (SKI). Secara kelembagaan, Prodi SKI saat itu berada dibawah naungan Fakultas Syariah dan bergabung bersama Ushuluddin, Adab dan Humaniora pada tahun 2015. Pada tahun 2016, sesuai dengan surat Keputusan Direktur Jenderal Pendidikan Islam Nomor 3517 Tahun 2016,  Prodi SKI berganti nama menjadi Prodi Sejarah Peradaban Islam (SPI).

Secara kepengurusan, Prodi SPI telah menjalani empat periode kepemimpinan. secara berurut, nama-nama yang pernah menjabat sebagai Ketua Prodi SPI adalah Dr. Sukron Makmun, S.H.I., M.Si. (2013-2015), Hario Aji Nugroho, S.Sos., M.A., (2015-2019), Dr. Sutrisna, S. Ag., M.Pd (2019-2022), Ahmad Faidi, M.Hum. (2022-Sekarang).

Hingga saat ini, alumni Prodi SPI telah tersebar di berbagai wilayah di Indonesia, baik di Pulau Jawa maupun di luar Pulau Indonesia. Bahkan, Prodi SPI terekam memiliki beberapa alumni berkebangsaan Thailand. Hingga tanggal 27 November 2025, Prodi SPI  telah berhasil meluluskan  sebanyak 504 alumni. Dalam data Traces Study, alumni SPI telah berkiprah dalam bidang pendidikan (Dosen, Guru, Wiraswasta, Pamong Wisata dan Budaya, dan berbagai macam profesi lainnya.